Nació en Yanci (Navarra) Hijo legítimo de Martín López de Zubiri y Marquesa de Apezechea.
Fue bautizado el 27 de julio de 1629. Fueron sus padrinos Joanes de Apezechea y María de Irigoyen.
Se casó en Yanci el 23 de diciembre de 1664 con María de Machiote. Hay constancia de cinco hijos:
María Francisca (Bautizada en Yanci el 24 de octubre de 1666), Pedro Miguel de Zubiri (Bautizado
en Yanci el 23 de septiembre de 1668), Jacinto (Bautizado en Yanci el 10 de noviembre de 1669),
Martín (Bautizado en Yanci el 12 de julio de 1671) y María Magdalena
(Bautizada en Yanci el 20 de enero 1675).