Nació en Yanci (Navarra)
Hijo legítimo de Joanes de Zubiri y María de Machiote.
Fue bautizado el 23 de septiembre de 1668.
Fueron padrinos Pedro de Machiote y María de Zubiri.
Se casó en Yanci el 24 de febrero de 1698 con María Josepha de Zozaia.
Hay constancia de un hijo: Pedro Miguel de Zubiri.